Учёные Университета ИТМО разработали программу Cellpose+, которая значительно ускоряет процесс проектирования материалов для регенеративной медицины. Инструмент расширяет возможности популярного фреймворка Cellpose, добавляя автоматический сбор статистики о форме, размере и других характеристиках клеток. Это позволяет быстрее анализировать совместимость биоматериалов с тканями человека, что крайне важно для создания медицинских имплантов, заживляющих покрытий и систем доставки лекарств.
Обычно исследователям приходится вручную обрабатывать сотни снимков клеток, что занимает несколько дней. Программа Cellpose+ сокращает этот процесс до нескольких минут благодаря алгоритмам машинного обучения. Она не только разделяет клетки на изображениях, но и сразу анализирует их ключевые параметры, включая плотность, площадь, форму, расположение ядер и уровень энтропии Вороного, который показывает, насколько упорядочена клеточная структура.
Раньше для сбора статистических данных приходилось выгружать снимки из Cellpose и обрабатывать в другой программе или вручную. Теперь обе эти функции соединены в одном инструменте. Сначала со снимками работает нейросеть. Она натренирована на сегментацию клеток на собранной в Cellpose библиотеке изображений. После с обработанными снимками работает уже наша программа. С помощью алгоритмов выделения признаков и анализа собираются и классифицируются данные. Затем результаты загружаются в отдельные файлы в соответствии с указанными характеристиками клеток, с которыми уже может работать ученый. На каждом из этапов работы Cellpose+ человек также может контролировать процесс обработки снимков, чтобы свести количество ошибок к минимуму.
В настоящее время разработчики тестируют программу на биоразлагаемых полимерах — полигидроксиалканоатах, которые могут использоваться для создания медицинских имплантов. В перспективе технологию можно адаптировать для других задач, таких как оценка эффективности противоопухолевой терапии, поиск аномальных клеток в диагностике или изучение механизмов клеточного деления.для
Код программы находится в открытом доступе, что позволяет учёным по всему миру использовать её в своих исследованиях.
Читайте ещё материалы по теме:
Новая технология обнаружения мин и взрывоопасных объектов разрабатывается в ТГУ
Биоматериал для лечения остеопороза разработан учёными Томского государственного университета
Программное обеспечение от пермских учёных ускорит испытание газотурбинных двигателей в 1,5 раза
Сейчас на главной
Анатолий Матвийчук: бомбардировщики дополняют ядерную триаду и действуют дистанционно
Причиной обрушения могло стать большое скопление снега
Минобороны оказалось довольно работой БПЛА повышенной грузоподъёмности
Форма фар автомобиля осталась прежней
Вице-премьер РФ подчеркнул приоритет надёжности турбовинтового лайнера перед сроками поставок
Боевая машина только за один вылет сбила 25 дронов
Технология успешно прошла испытания
Проект реализуют на заводе в Нижнем Новгороде, где раньше производили Skoda и Volkswagen
Business Insider: Новые ракеты превратили самолёт в опасного противника
Экипаж провёл тесты аэродинамики и приёмников воздушного давления на высотах
Стартовая цена вокзала на торгах — 4 млрд рублей
Серийное производство планируют запустить в этом году на гигафабрике в Красной Пахре