Учёные Университета ИТМО разработали программу Cellpose+, которая значительно ускоряет процесс проектирования материалов для регенеративной медицины. Инструмент расширяет возможности популярного фреймворка Cellpose, добавляя автоматический сбор статистики о форме, размере и других характеристиках клеток. Это позволяет быстрее анализировать совместимость биоматериалов с тканями человека, что крайне важно для создания медицинских имплантов, заживляющих покрытий и систем доставки лекарств.
Обычно исследователям приходится вручную обрабатывать сотни снимков клеток, что занимает несколько дней. Программа Cellpose+ сокращает этот процесс до нескольких минут благодаря алгоритмам машинного обучения. Она не только разделяет клетки на изображениях, но и сразу анализирует их ключевые параметры, включая плотность, площадь, форму, расположение ядер и уровень энтропии Вороного, который показывает, насколько упорядочена клеточная структура.
Раньше для сбора статистических данных приходилось выгружать снимки из Cellpose и обрабатывать в другой программе или вручную. Теперь обе эти функции соединены в одном инструменте. Сначала со снимками работает нейросеть. Она натренирована на сегментацию клеток на собранной в Cellpose библиотеке изображений. После с обработанными снимками работает уже наша программа. С помощью алгоритмов выделения признаков и анализа собираются и классифицируются данные. Затем результаты загружаются в отдельные файлы в соответствии с указанными характеристиками клеток, с которыми уже может работать ученый. На каждом из этапов работы Cellpose+ человек также может контролировать процесс обработки снимков, чтобы свести количество ошибок к минимуму.
В настоящее время разработчики тестируют программу на биоразлагаемых полимерах — полигидроксиалканоатах, которые могут использоваться для создания медицинских имплантов. В перспективе технологию можно адаптировать для других задач, таких как оценка эффективности противоопухолевой терапии, поиск аномальных клеток в диагностике или изучение механизмов клеточного деления.для
Код программы находится в открытом доступе, что позволяет учёным по всему миру использовать её в своих исследованиях.
Читайте ещё материалы по теме:
Новая технология обнаружения мин и взрывоопасных объектов разрабатывается в ТГУ
Биоматериал для лечения остеопороза разработан учёными Томского государственного университета
Программное обеспечение от пермских учёных ускорит испытание газотурбинных двигателей в 1,5 раза
Сейчас на главной
«Ространсмодернизация» и Госкорпорация по ОрВД обсудили развитие аэродромной сети России
Росатом и фонд «Долина Менделеева» разработают технологии разделения РЗМ
Classic Plus и Comfort'24 исчезли из прайс-листа
Гендиректор Концерна «Алмаз-Антей»: Нельзя медлить, отвечая на современные вызовы в ОПК
Новая ML-модель автоматически выгружает неактивные вкладки, снижая расход оперативной памяти до 36%
Грузоподъёмность погрузчика — 1700 кг, высота подъёма стрелы — 4 м
Агентство ANI: На переговорах могут обсуждать модернизацию Су-30, поставки ракет для ЗРК С-400
Впервые за 25 лет на станции одновременно пришвартованы российские, американские и японские корабли
Баканов анонсировал масштабное сотрудничество России и Индии в космической сфере
Предприятия ОПК выпускают значительный объём вооружений
Космонавты Сергей Рыжиков, Алексей Зубрицкий и астронавт NASA Джонатан Ким завершат миссию 9 декабря
Экипаж экпедиции МКС-74 адаптируется к невесомости и готовится к более чем 40 научным экспериментам